Une Baleine à la Terre est un projet de longue haleine de récupération de mammifères marins échoués et de sensibilisation. Ce projet a mené, à la récupération de plusieurs baleines échouées sur les plages des Îles-de-la-Madeleine et au montage, en 2003, d'un squelette de petit rorqual. Le résultat de cet ambitieux casse-tête peut être aujourd'hui admiré à l'Aquarium.

En association à ce projet, l'Aquarium a aussi présenté "Des Monstres et des Hommes", une conférence sur le thème des mammifères marins, mettant l'emphase sur les mythes entourant les baleines, les phoques et les morses et départageant les faits des histoires abracadabrantes entourant ces géants. Ces monstres ayant depuis longtemps alimenté contes, légendes et récits créateurs font encore jaser aujourd'hui et suscitent toujours débats et coup de coeur partout sur la planète.

Le 28 septembre 2004, un jury composé de directeurs de grands musées québécois a décerné à l'Aquarium des Îles, le prix d'excellence de la Société des musées québécois 2004, pour la récupération et le montage du squelette de petit rorqual mâle échoué à la Dune-du-Sud en 2003. Madame Sophie Fortier, directrice de l'Aquarium, est allée à Rimouski, recevoir ce prix honorifique lors du congrès annuel de la Société des musées québécois, au nom de toute l'équipe de bénévoles et de partenaires impliqués dans le projet. Le Jury a choisi ce projet parmi beaucoup d'autres de grande qualité. Notre projet : « Une Baleine à la Terre » a retenu l'attention pour l'implication des gens du milieu, le professionnalisme de la démarche ainsi que la valeur importante de la pièce pour la collection scientifique de l'Aquarium et au Québec.